تشكل التغيرات المناخية تحديًا كبيرًا للاستزراع السمكي، حيث ارتفاع درجات الحرارة يؤدي إلى زيادة درجة حرارة المياه، مما يؤثر على الأنواع السمكية المستزرعة، وبعض الأنواع تكون حساسة للحرارة العالية وتعاني من ضعف النمو والمناعة، مما يؤدي إلى تأثير سلبي على الإنتاجية.